摩托車駕駛證脫審三年后，將面臨注銷的可能。在這種情況下，車主需要將摩托車交給廢棄摩托車回收拆解企業進行拆解，并確保企業按規定完成登記、拆解和銷毀工作。

隨后，車輛的登記證書、行駛證、號牌等相關文件將被交給交管部門進行注銷。

此外，摩托車還需要按照規定進行年審。根據《中華人民共和國道路交通安全法實施條例》第十六條，四年內的摩托車每兩年需要進行一次檢驗；超過四年的摩托車則需要每年進行一次檢驗。

針對摩托車脫審的處理辦法如下：

1. 脫審時間在三個月以內的車輛，應前往車管所進行補審。一般情況下，這種情況會受到口頭警告。

2. 若脫審時間在三個月到兩年之間，一般會處以50元以上200元以下的罰款。

3. 對于超過兩年未審驗的摩托車，將直接注銷其車輛檔案。若要恢復檔案，車主需先支付罰款。