根據《道路交通安全違法行為記分管理辦法》，對于在高速公路應急車道上違法停車的處罰是扣6分。

在高速公路行駛過程中，如果發生車輛故障或拋錨等特殊情況，駕駛員應盡快將車輛移至應急車道內，并及時撥打高速公路救援電話。當車輛停好后，必須開啟車輛的雙閃警示燈，以提醒其他車輛注意。此外，在車輛后方約150米處放置警示三角架，用于警示后方來車。

我們都清楚，高速公路上車輛行駛速度較快，一旦突然停車，極易引發交通事故。因此，高速公路上的違停行為被視為嚴重的交通違法行為。不僅會受到扣分處罰，還可能面臨罰款。