廣州南站站內換乘需要20分鐘以上，最好是預留40分鐘，這個時間是受到廣州南站規模的影響。因為南站的建設規模比較大，換乘的時候需要走的距離比較遠，所以用時也會比較長，還有廣州的南站是老站改造而成的，一站臺是無法站內換乘的，需要到其他的站臺才可以去換乘，所以比較浪費時間。

廣州南站的站內換乘，大大節省了持有聯程火車票的乘客，也就是換乘的乘客不需要出站再進站，省去了很多的麻煩。到站之后只需要根據車站的指引，經過一層南端的中轉換乘區域就可以等候換乘的列車了。

在廣州南站的一層南端中轉換乘區域，一共有9個換乘口，另外還有自助售票、取票、退票功能的機器，配備了充足的候車座位和廁所、飲水處等公共設施。可以為2~28站臺的乘客提供換乘服務。

但是要注意，廣州南站的一站臺是不具備換乘條件的，所以乘客如果是到達一站臺后要換乘，就需要前往其他站臺，從其他站臺前往一站臺換乘，也需要通過出站扶梯，然后再從東南或者是東北的實名制驗證區域進站才能夠乘車。

要注意第1次來南站占地換乘的乘客，在下車的時候千萬不要跟著人流直接走，否則很有可能會出站，如果出站之后想要換乘，就需要重新進站，重新安檢，這樣會比較浪費時間，有可能就會錯過換乘的列車。