摩托車水車被交警查到的話，會被扣車、罰款和拘留，情節嚴重的話還可能涉嫌走私而被定罪。所以，如果摩托車是水車，沒有正規的購物渠道或者發票，就不要騎著它上路，被交警查住的話后果很嚴重。

所謂的“水車”也就是靠走私而運入國內銷售的一手車、二手車或拼裝車，這種車沒有通過正規渠道進入國內，銷售商無法提供正規手續，如沒有發票和合格證等有效證件，買了這樣的摩托車，無法在公安機關交管部門辦理駕駛證和牌照等手續，如果駕駛這樣的摩托車上路，只要被查到，就一定會被扣車和罰款。

為了駕駛這樣的摩托車上路，一些人通過套牌、偽造車牌和駕駛證、使用他人車牌和駕駛證來實現逃避處罰的目的，而這些違法行為只要被交警發現，不僅會扣留摩托車“水車”，還會對駕駛人罰款2000元-5000元，行政拘留15天以內。此外，如果駕駛人使用的是本人的摩托車駕駛證，交警將一次性扣除12分，予以警告。

在認定車主是不是涉嫌違反走私時，需要通過兩個方面來判定，一是要看水車是不是車主直接向走私人非法收購的；二是要看車主知不知道這輛車是水車。如果明知道是水車還要購買或收購的話，金額巨大的和情節嚴重的涉嫌違反走私罪，法院會根據當事人違法行為的輕重來判刑。